1.簡介
在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號積累實(shí)時(shí)監(jiān)測整個(gè)PCR進(jìn)程,z后通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對未知模板進(jìn)行定量分析的方法。分為SYBRGreen法與TaqMan探針法。
熒光染料法:實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)簡單(僅需2個(gè)引物,無需設(shè)計(jì)探針),初始成本低,靈敏度高,但需要進(jìn)行熔解曲線分析檢驗(yàn)擴(kuò)增反應(yīng)的特異性。適用于非特異性檢測(專一性要求不高或高通量檢測)。
探針法:有高特異性(引物和探針共同于模板結(jié)合),高信噪比,能進(jìn)行多重反應(yīng)。但成本高,實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)繁瑣。適用于擴(kuò)增序列專一檢測。
2.服務(wù)流程

1. 送樣要求
(1)A:細(xì)胞、細(xì)菌、真菌、動植物組織等均可寄送,為了保證實(shí)驗(yàn)要求,樣品數(shù)盡可能準(zhǔn)備充足。

注意事項(xiàng)
1. 組織在1-2min內(nèi)完成取材,速凍,并立即放入-80℃或液氮中保存。
2. 有條件的話,z好先將樣本在液氮中速凍,再轉(zhuǎn)入-80℃冰箱中保存。
3. 使用的凍存管z好也用DEPC處理。
4. 對于組織及細(xì)胞樣本,如果沒有液氮或-80℃冰箱,也可用RNAlater保存,但是組織一定要切成比較小的塊狀,-20℃保存運(yùn)輸。
B:細(xì)胞沉淀:細(xì)胞量大于10^6的細(xì)胞/組;細(xì)菌沉淀:細(xì)菌量大于10^8的細(xì)菌/組;
C:土壤、污泥樣本:至少10g;
D:環(huán)境水樣:至少1L/組,寄送裝有過濾定量水樣的濾膜(4°C),干燥寄送。 如果其他樣品寄送需求,請與工作人員溝通確認(rèn)!
(2)待測樣品為RNA樣品及cDNA樣本,RNA濃度不低于200ng/uL,DNA濃度不低于20ng/uL,核酸體積10uL/檢測基因,且樣品接收后需先進(jìn)行質(zhì)檢,質(zhì)檢合格的開展后續(xù)項(xiàng)目(核酸樣本需包裝完整,離心管用封口膜封閉,干冰寄送)。
(3)不接受具有致病性的樣品。
(4)待測樣品(原始樣品或者RNA或者cDNA,原始樣品可由我們代處理,RNA樣品及cDNA樣本接收后需先進(jìn)行質(zhì)檢,質(zhì)檢合格的開展后續(xù)項(xiàng)目);
(5)提供所需的引物/標(biāo)準(zhǔn)品(或平臺代設(shè)計(jì)及合成);提供檢測基因的序列和引物序列,若基因序列來自文獻(xiàn)等其他途徑,可以多參考幾組,避免引物特異性不足,延長實(shí)驗(yàn)周期。
(6)其他所涉及的細(xì)胞、試劑盒以及生物耗材等平臺都可以有償提供。
1、熔解曲線出現(xiàn)雙峰的原因?
引物設(shè)計(jì)不夠優(yōu)化:應(yīng)避免引物二聚體和發(fā)夾結(jié)構(gòu)的出現(xiàn)。
引物濃度不佳:適當(dāng)降低引物的濃度,并注意上下游引物的濃度配比。
鎂離子濃度過高:適當(dāng)降低鎂離子濃度,或選擇更合適的 mix 試劑盒。
模板有基因組的污染:RNA提取過程中避免基因組DNA的引入,或通過引物設(shè)計(jì)避免非特異擴(kuò)增。
2、CT值出現(xiàn)太晚,偏大?
擴(kuò)增效率低: 反應(yīng)條件不夠優(yōu)化。設(shè)計(jì)更好的引物或探針;改用三步法進(jìn)行反應(yīng);適當(dāng)降低退火溫度;增加鎂離子濃度等。
PCR各種反應(yīng)成分的降解或加樣量的不足。
PCR產(chǎn)物太長: 一般采用80-150bp的產(chǎn)物長度。
3、陰性對照出現(xiàn)明顯擴(kuò)增
反應(yīng)體系污染:更換新的Mix、ddH2O、引物重復(fù)實(shí)驗(yàn)。反應(yīng)體系在超凈工作臺內(nèi)配制,減少氣溶膠污染。
引物二聚體的出現(xiàn):配合熔解曲線進(jìn)行分析。